《默克索引》是化学工程、药物开发和生物研究的权威综合类百科全书。

1889年由美国默克集团开发，最初仅记载该公司出品的化学品和药品目录。一百多年来已经成为化学合成物信息的权威来源，并在全球累积销售超过百万册，并誉为化学领域的“圣经”。2013年起《默克索引》（第十五版）由英国皇家化学会正式出版，共收录超过一万种在研究、产业和环境方面具有重要影响力的合成物信息。是从事有机化学、生物化学、药理学、毒理学、药学、材料、物理、食品和环境领域从事研究的学者和产业界人士必备工具书。

该书信息量大，全书收录超过一万多种化合物的性质、制法以及用途等详细信息，并汇总了这些物质的俗名、商品名、化学名、结构式，以及商标和生产厂家名称等资料。注重对药理、临床、毒理以及毒性的研究资料整理，对于生理作用和药用价值的化合物登载非常完全。与同类工具书相比，其更新速度更快，使用方便并且支持药名字序查询、按照治疗学分类和生物活性索引、分子式索引、交叉主题索引等多种查询方式。

同历史版本相比，第15版超过500种新辞条，并且35%的14版内容更新，同时具有1300种新化学结构。同时提供非专有名称词条表、根据最新IUPAC标准提供的分子量和修正周期表和原子量表等重要信息。