各位科研人员、研究生:
信息中心已联系开通药渡数据百万活性分子数据库试用,欢迎大家积极使用。
资源网址:https://data.pharmacodia.com/active-panorama/#/homePage。
访问方式:个人账号密码登录。药渡数据库账号注册详情见:https://ic.simm.ac.cn/simmic/resource/db/ic_b30e14f9084b4d799e308170d8079ba1。
试用期限:即日起至2023年5月31日。
资源简介:
药渡百万化合物分子库可检索查看结构类似或原理类似的药物已披露的活性数据。
数据范围:
1、收录233万活性分子数据,其中包括化药小分子190多万活性分子,蛋白超过2万。
2、分子结构方面:收录了化合物分子基本数据,五规则数据,其中分子的mol文件、smiles文件均可直接复制或者下载,对于做药物发现的同事非常方便。
3、分子活性数据方面:收录化合物蛋白结合试验、蛋白质功能检测、药代动力学试验、毒理试验、理化试验等数据,具体指标包含IC50、 Kd 、Ki、KB、KA、Km、LogD、LogP、溶解度、pka等,并有相应的试验方案描述可参考,还可以对参考文献进行追踪溯源。
应用场景介绍:
1、结构式检索,可直接检索到相似化合物,并对比结构相似化合物的活性数据。
2、多维度筛选,满足药物发现工作者对于分子结构的精细化调研需求。
3、药物名称检索,可查询到本化合物所有相关试验及数据。
4、靶点检索,查询靶蛋白的试验数据。
说明:百万活性分子库在药渡数据【全球药物】-->【品种】下,可直接检索活性分子、靶点、文献、专利(见图1、图2)。
图1-百万活性分子检索入口
图2-百万活性分子检索页面
此外,药渡数据【全球药物】等药物检索模块,还可以筛选药物【是否有活性指标】(图3),并在查阅某药物详细信息时,可点击【活性全景】查看活性数据(图4)。
图3-药物检索模块【是否有活性指标】筛选演示
图4-某药物信息下【活性全景】展示
使用资源时请自觉遵守相关法律法规,尊重知识产权,合理使用。如有问题请联系陆老师,xkzx@simm.ac.cn。
中国科学院上海药物研究所信息中心
2023年5月17日